Terapia podstawowa AZS wbrew pozorom nie opiera się na lekach, a emolientach, czyli specjalistycznych preparatach, przywracających skórze atopowej funkcje barierowe. Emolientowy krem na atopowe zapalenie skóry redukuje świąd i suchość, przez co wpływa pozytywnie na ogólne samopoczucie. Na rynku dostępne są jednak różne produkty emolientowe: balsamy, żele pod prysznic, szampony. Wśród leków w ostatnich latach dużą popularnością cieszą się inhibitory kalcyneuryny (pimekrolimus i takrolimus), które ograniczają stan zapalny skóry, a ryzyko związane z ich stosowaniem jest mniejsze niż w przypadku GKS. Glikokortykosteroidy mogą bowiem powodować ścieńczenie skóry, spowolnione gojenie się ran czy trądzik. Jeżeli jednak dochodzi do zaostrzenia AZS, a postępowanie pierwszego rzutu nie daje oczekiwanych rezultatów, wówczas sięgnięcie po leki sterydowe jest koniecznością i może zapobiec bardzo poważnym komplikacjom, przede wszystkim zakażeniom. Lekarze ustalają więc takie dawki glikokortykosteroidów, które redukują objawy, przy niewielkim ryzyku powikłań. Aby ich uniknąć, nie powinno się sięgać po lek częściej niż dwa razy dziennie, stosować go na jak najmniejszym obszarze ciała, a terapia powinna trwać jak najkrócej. Trzeba pamiętać, że działania niepożądane rozwijają się przede wszystkim w wyniku nieprawidłowego używania GKS.